英雄间的对决
在将自己塑造成一档真人秀节目的英雄后，新勇士组织进入了一栋住有四名超级反派的房子里：他们分别是钴人、寒心、硝化人和狂飙。
在接下来的战斗中，硝化人在康涅狄格州的斯坦福德市中心发生了自爆。这场爆炸造成600多人死亡，其中包括了新勇士的三名成员:菌人、娜摩丽塔和夜鸫。
硝化人的自爆造成了600+平民的伤亡
要么注册,要么…
公众对这场悲剧的强烈抗议促使国会通过了“超能力者登记法”，该法案要求美国所有超能力人士向政府注册——并作为神盾局的一份子为其效力——否则就将面临监禁。
其实在M日事件发生后，公众已经在推动此类保障措施，而斯坦福德灾难则为该法案的最终通过提供了动力。
依照法案向政府登记注册的卡罗尔
新法案将超级英雄阵营一分为二。许多英雄意识到了这部法案的必要性，并有意遵守它。然而另外一些英雄却认为这是一部糟糕的法案，并试图与之作斗争。
那些支持这项法案的人由钢铁侠、神奇先生和汉克·皮姆博士领导，然而 美国队长 却拒绝协助神盾局，他转入地下成立了 秘密复仇者联盟 ，作为其抵抗运动的核心。
法案一生效，神盾局便开始围捕法外英雄，接着这些抵抗力量就会前往解救他们。
英雄间的对决
值得一提的是，大多数的法案支持者一开始就有对外公开的身份。相反，那些抗议法案的人却没有。
其中支持者里最著名的例外（之前未对外公开身份）是蜘蛛侠，他和他的导师钢铁侠一派。经过一番思想斗争的他在一次全球电视新闻会议上，揭示了其为彼得·帕克的秘密身份。
摘下面罩的蜘蛛侠引发了轰动
在冲突（很快被称为“内战”）期间，X战警正式宣布持中立态度。虽然他们同情抵抗派，但由于M日事件使变种人几近消亡，因此他们不希望冒着被根除的风险。
中立／抵抗／支持
在两大阵营的第一次主要冲突中，神盾局释出了一个克隆雷神。这个克隆体杀死了巨人(比尔·福斯特)，且还要伤害其他英雄。这迫使隐形女不得不变更立场来保护抵抗派。
克隆雷神杀死了巨人（黑歌利亚）
这一事件导致双方的英雄们开始重新考虑他们的选择:蜘蛛侠加入了美国队长的阵营，而夜鹰和 易身女 则决定登记注册。
不顾一切的美国队长和他的英雄们向神奇先生在负空间建造的一所超级监狱发动了进攻。预感此事发生的钢铁侠则领导了一支队伍来阻止他们。
随后斗篷将整场战斗传送回了曼哈顿，抵抗派轻松获胜。但一群消防队员、急救人员以及警察阻止了美国队长杀死钢铁侠。
环顾这场战争引起的破坏，美国队长意识到自己的团队实际上只是赢得了“除了舆论外的一切”。于是他向纽约市警局投降了，这立竿见影地结束了内战。
余波过后，钢铁侠成为了神盾局的新任局长，并发起了五十州联盟倡议。
最终役
在内战的激斗中，美国队长的抵抗力量应战钢铁侠的政府支持力量。这场战斗爆发于位于负空间的最高戒备监狱，名为“42”——因为这是钢铁侠团队为改善世界而提出的第42种想法。
42
当斗篷将整场战斗传送回正常世界时，战火蔓延到了纽约市。在战斗的最后时刻，美国队长击败了钢铁侠，可当其有机会打出致胜一击时，他却犹豫了。
看着周围的残破景象，他意识到内战是导致了多少的无辜百姓被捕被伤害，于是他投降了。没了队长，抵抗派势力支离破碎，内战也随之结束。
最终役
结束后的不久，当 美国队长 戴着手铐进入联邦法院时，他遭到了受红骷髅指使的人的刺杀。
后来，他的老搭档 巴基·巴恩斯 冠上了他的名号与盾牌，并与一支法外复仇者联盟合作。他们致力于打击罪犯及拯救世界的同时，置身在法律之外。
漫威百科全书原文
《美国队长3:内战》艺术照
